Геномную обзор грибов, живущих на нашей коже обеспечивает основу для понимания того, как эти микробы способствуют здоровью кожи и болезней.
Сложные сообщества микробов живут на поверхности нашего тела. Эти грибы, бактерии и вирусы, все вместе известны как микробиомом кожи. Команда из Национального научно-исследовательского института НИЗ генома человека (NHGRI) и Национального института рака (NCI) ранее использовались геномные методы для изучения бактерии кожи. Они обнаружили различные бактериальные сообщества, которые различались между людьми и участок кожи. В своем новом исследовании, команда использовала аналогичный геномный подход, чтобы получить лучшее понимание грибов, которые живут на нашей коже.
Грибы включают в себя формы, грибы и дрожжи, которые используются для брожения хлеб и пиво. Эти микробы были связаны с многих кожных заболеваний и состояний, в том числе спортсмена пешком, экзема, перхоть и инфекций ногтя на пальце ноги. Грибковые инфекции кожи влияют примерно 29 миллионов человек по всей стране. Но грибы могут быть медленным и трудно выращивать в лабораториях, делая грибковые инфекции трудно идентифицировать и лечить.
в мае 22, 2013, ученые собрали образцы на сайтах тела 14 от здоровых взрослых 10. Они были сосредоточены на фрагменте ДНК, разделяемом всеми грибами - промежуточным внутренним транскрибированным спейсером 1 (ITS1) рибосомальной РНК, который можно было использовать для классификации грибов на уровне рода с точностью более 97%.
Путем создания более чем 5 миллионов последовательностей ITS1 из образцов, команда смогла идентифицировать больше, чем родственные типы грибов 80, живущие на коже человека. Напротив, традиционные методы культивирования могут идентифицировать только типы 18. были обнаружены на всех участках кожи. были преобладающим типом на 11 сайтов 14, в том числе за ушами, в ноздрях, на спине и на руках.
Команда обнаружила, что пятки, которые не проявляют обширного бактериального разнообразия, были наиболее сложным местом для грибов, в которых представлены представленные 80 типы. Новички, имеющие около 60 типов, и ногти на ногах, с 40, имели следующие самые высокие уровни грибкового разнообразия. У рук и рук, которые содержат большое разнообразие бактерий, было относительно мало видов грибов. Грибковые сообщества на основном корпусе были довольно стабильными с течением времени, с небольшими изменениями при тестировании до 3 месяцев. Напротив, грибы на ногах значительно изменились в течение 3 месяцев, возможно, отражая больше воздействия на окружающую среду.
Грибковые сообщества на человеческом теле сложны и специфичны для конкретного места », - говорит со-старший автор доктор Хайди Конг из NCI. Получив более полное представление о грибковых и бактериальных экосистемах, мы можем лучше решать связанные с этим кожные заболевания, в том числе грибковые инфекции, которые могут быть связаны с лечением рака.
Данные нашего исследования дают нам базовые сведения о нормальных людях, которых у нас никогда не было », - говорит соавтор доктор Джули Сегре из NHGRI. Суть в том, что ваши ноги изобилуют грибковым разнообразием, поэтому наденьте ваши шлепанцы в раздевалках, если вы не хотите смешивать грибы ног с чужими грибами.
