Есть несколько причин, по которым тест RT-PCR может дать ложноположительный результат. Shutterstock

Два случая COVID-19, ранее связанных с текущей вспышкой в ​​Мельбурне, теперь зарегистрированы. реклассифицировала как ложные срабатывания.

Они больше не учитываются в официальном подсчете дел Виктории, а ряд сайтов, связанных с этими случаями, был удален.

Основным и «золотым стандартом» для выявления SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19, является тест полимеразной цепной реакции с обратной транскриптазой (ОТ-ПЦР).

Тест RT-PCR очень специфичен. То есть, если у кого-то действительно нет инфекции, высока вероятность, что тест окажется отрицательным. Тест также очень чувствителен. Итак, если кто-то действительно заражен вирусом, высока вероятность, что тест окажется положительным.

Но даже несмотря на то, что тест очень специфичен, все же остается небольшой шанс, что кто-то, у кого нет инфекции, вернет положительный результат теста. Это то, что подразумевается под «ложным срабатыванием».

Во-первых, как работает тест RT-PCR?

Хотя в эпоху COVID большинство людей слышали о тесте ПЦР, Как это работает по понятным причинам немного загадка.

Короче говоря, после взятия мазка из носа и горла химические вещества используются для извлечения РНК (рибуноклеиновая кислота, тип генетического материала) из образца. Он включает обычную РНК человека и РНК вируса SARS-CoV-2, если они есть.

Затем эта РНК преобразуется в дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) - вот что означает бит «обратной транскриптазы». Чтобы обнаружить вирус, крошечные сегменты ДНК амплифицируются. С помощью специального флуоресцентного красителя образец идентифицируется как положительный или отрицательный на основании яркости флуоресценции после 35 или более циклов амплификации.

Что вызывает ложноположительные результаты?

Ассоциация основные причины к ложноположительным результатам относятся лабораторная ошибка и нецелевые реакции (то есть перекрестная реакция теста с чем-то, кроме SARS-CoV-2).

Лабораторные ошибки включают канцелярскую ошибку, неправильный анализ образца, перекрестное заражение чужим положительным образцом или проблемы с используемыми реагентами (такими как химические вещества, ферменты и красители). Кто-то, кто переболел COVID-19 и выздоровел, также может показать ложноположительный результат.

Насколько распространены ложноположительные результаты?

Чтобы понять, насколько часто возникают ложноположительные результаты, мы смотрим на частоту ложноположительных результатов: долю протестированных людей, у которых нет инфекции, но которые вернули положительный результат.

Авторы недавнего препринт (документ, который еще не прошел рецензирование или независимую проверку другими исследователями), был проведен обзор свидетельств ложноположительных результатов для теста RT-PCR, используемого для обнаружения SARS-CoV-2.

Они объединили результаты нескольких исследований (некоторые из них специально рассматривали ПЦР-тестирование на SARS-CoV-2, а некоторые - на ПЦР-тестирование на другие РНК-вирусы). Они обнаружили ложноположительные результаты в размере 0–16.7%, а в 50% исследований - 0.8–4.0%.

Частота ложных срабатываний в систематическом обзоре была в основном основана на тестировании обеспечения качества в лабораториях. Вероятно, что в реальных ситуациях точность хуже, чем в лабораторных исследованиях.

A в систематическом обзоре глядя на количество ложноотрицательных результатов при тестировании с помощью ОТ-ПЦР для SARS-CoV-2, было обнаружено, что количество ложноотрицательных результатов составляет 1.8-58%. Однако они указывают на то, что многие исследования были низкого качества, и эти выводы основаны на доказательствах низкого качества.

Нет идеального теста

Скажем, например, реальная частота ложных срабатываний составляет 4% для тестирования SARS-CoV-2 RT-PCR.

Мы ожидаем, что на каждые 100,000 4,000 человек с отрицательным результатом теста и действительно не инфицированным, будет XNUMX XNUMX ложноположительных результатов. Проблема в том, что о большинстве из них мы никогда не узнаем. Человека с положительным результатом теста просят поместить в карантин, и все предполагают, что у него бессимптомное заболевание.

Это также сбивает с толку тот факт, что количество ложных срабатываний зависит от основной распространенности заболевания. При очень низкой распространенности, как мы видим в Австралии, количество ложных срабатываний может в конечном итоге оказаться намного выше, чем фактическое истинное количество срабатываний, что известно как ложноположительный парадокс.

Из-за характера нынешней вспышки в Виктории власти, вероятно, проявляют особую бдительность в отношении результатов тестов, что потенциально повышает вероятность получения ложноположительных результатов. В Правительство Виктории заявило:

После анализа, проведенного экспертной комиссией, и повторного тестирования в Справочной лаборатории по инфекционным заболеваниям штата Виктория, два случая, связанных с этой вспышкой, были признаны ложноположительными.

Это не проясняет, были ли повторно протестированы два человека или были повторно протестированы только образцы.

В любом случае, два ложных срабатывания - это не повезло. Но, учитывая то, что в настоящее время в Виктории ежедневно проходят тестирование большое количество людей, и тот факт, что мы знаем, что будут иметь место ложные срабатывания, это не является неожиданным.

Более широкие последствия

Лицо, получившее ложноположительный результат теста, будет вынуждено отправиться в карантин, когда в этом нет необходимости. Когда вам говорят, что у вас потенциально смертельное заболевание, это очень тяжело, особенно для пожилых людей или тех, кто находится в группе риска из-за других заболеваний. Они также, вероятно, будут беспокоиться о том, чтобы заразить других членов своей семьи, и могут потерять работу во время карантина.

В частности, данные органы власти первоначально указали на эти два случая. как примеры о передаче вируса через «мимолетный» контакт, несомненно, многие люди задавались вопросом, не окажется ли Виктория без этих случаев в изоляции. Это всего лишь предположение, и мы не можем точно знать, так или иначе.

Очевидно, что ложноотрицательные результаты очень беспокоят, поскольку мы не хотим, чтобы в сообществе бродили заразные люди. Но ложные срабатывания также могут быть проблематичными.